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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  40 lines
  1. *****************************************************************
  2. * Aminotransferases class-I pyridoxal-phosphate attachment site *
  3. *****************************************************************
  4.  
  5. Aminotransferases  share certain mechanistic features with   other  pyridoxal-
  6. phosphate dependent enzymes, such as  the  covalent  binding of the pyridoxal-
  7. phosphate group  to  a  lysine  residue.  On the basis of sequence similarity,
  8. these various  enzymes  can  be  grouped [1,2] into subfamilies. One of these,
  9. called class-I, currently consists of the following enzymes:
  10.  
  11.  - Aspartate aminotransferase (AAT) (EC 2.6.1.1). AAT catalyzes the reversible
  12.    transfer of  the  amino  group  from  L-aspartate to 2-oxoglutarate to form
  13.    oxaloacetate and  L-glutamate.  In  eukaryotes, there are two AAT isozymes:
  14.    one is  located  in the mitochondrial matrix, the second is cytoplasmic. In
  15.    prokaryotes, only one form of AAT is found (gene aspC).
  16.  - Tyrosine  aminotransferase  (EC  2.6.1.5) which catalyzes the first step in
  17.    tyrosine catabolism  by  reversibly  transferring  its  amino  group  to 2-
  18.    oxoglutarate to form 4-hydroxyphenylpyruvate and L-glutamate.
  19.  - Aromatic  aminotransferase  (EC 2.6.1.57) involved in the synthesis of Phe,
  20.    Tyr, Asp and Leu (gene tyrB).
  21.  - 1-aminocyclopropane-1-carboxylate  synthase   (EC 4.4.1.14)  (ACC synthase)
  22.    from plants.   ACC   synthase   catalyzes   the   first  step  in  ethylene
  23.    biosynthesis.
  24.  
  25. The sequence around the pyridoxal-phosphate  attachment site  of this class of
  26. enzyme is sufficiently conserved to allow the creation of a specific pattern.
  27.  
  28. -Consensus pattern: [GS]-[LIVMFYTC]-[SA]-K-x(2)-[GSALV]-[LIVMF]-x-[GNAR]-x-R-
  29.                     [LIVMA]-G
  30.                     [K is the pyridoxal-P attachment site]
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  32. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  33. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  34.  
  35. [ 1] Bairoch A.
  36.      Unpublished observations (1992).
  37. [ 2] Sung M.H., Tanizawa K., Tanaka H., Kuramitsu S., Kagamiyama H.,
  38.      Hirotsu K., Okamoto A., Higuchi T., Soda K.
  39.      J. Biol. Chem. 266:2567-2572(1991).
  40.